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2023．02
轟動武林! 驚動萬教!
號稱有史以來最強的 Nanopore 試劑更新 --- R10.4.1 combo Kit 14
原創文章 引用請註明出處
Nanopore 表示: 不許再說我不準!! 準確率媲美 Illumina!!
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Nanopore 表示: 不許再說我不準!! 準確率媲美 Illumina!!
ONT 於 2022 年發表了最新推出的 Kit14 試劑，搭配 R10.4.1 晶片 系列引起了廣大的轟動，在今年終於由 Early access 階段正式進入 Release 階段，給科學家們更準、更快、更多的數據產出。
本篇幫大家快速統整R10.4.1 + Kit 14 的優勢比較，讓你走在科學界尖端中的尖端!
- R10.4.1 combo Kit 14 到底好在哪?
- 正式跨入 Q20+ 世代，原始數據 (單邊定序模式) 準確度提升至 99.35% (Q22)
- R10 雙邊定序模式 (duplex)*，提高了 indel 和 polymer 的讀取準確率至 >99.9% (Q30)
- Kit14提供更快更高準確率的馬達蛋白
- 變異檢測 F1 score 達 96% (SV) ~ 99.9% (SNV)
- 甲基化檢測準確率達 99.5%
- 目前單片晶片最高數據紀錄達 350 Gb/flowcell (官方) / 245 Gb/flowcell (外部)
- 目前最長單條讀長紀錄達 4.2 Mb (官方) / 2.3 Mb (外部)
- ONT R10.4.1 + kit 14 和R9.4.1 + Kit 10的比較
| 試劑/晶片版本 | R9.4.1 + Kit 10 | R10.4.1 + kit 14 |
| 準確率 | Q17 | Q20+ |
| SNP (F1 score) | 99.8% | 99.9% |
| INDEL (F1 score) | 82.5% | 89.4% |
| SV (F1 score) | 96.4% | 96% |
| 甲基化準確率 | 97.5% | 99.5% |
| 雙邊定序模式 (duplex) | 無 | 有 |
- ONT R10.4.1 + kit 14 最新官方數據
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參考資料
1. Nanopore Community Meeting 2022, https://nanoporetech.com/resource-centre/video/ncm22/update-from-oxford-nanopore?fbclid=IwAR3tcRheJ-71pquxfchYJ99PBfkxI71FhybL8Kk1mDa9BLchSjskr7Tx90s
圖爾思生物科技 / 微生物體研究中心
吳雁韻 文案
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