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2021．08
如何獲得高品質的RNA
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RNA的品質在後續的應用上扮演著決定性的角色，一般來說用來評斷RNA品質的好壞除了常聽到的260/280、260/230 ratio外，利用RNA integrity number (RIN)值來判斷RNA片段的完整性是另一個評定RNA品質較為重要的指標。但RNA相對來講較不穩定，也容易受到很多因素的影響而發生降解。
因此，獲得高品質的RNA樣品變成是許多研究者努力的目標。在人體眾多的組織中，胰臟組織又因為富含RNase、DNase跟protease的關係而更加難以取得高RIN值的RNA樣品，因此在2018年所發表的文章中，作者利用胰臟組織，針對從採樣到萃取等五個不同的條件來加以探討影響RNA品質的因素：
RNA的品質在後續的應用上扮演著決定性的角色，一般來說用來評斷RNA品質的好壞除了常聽到的260/280、260/230 ratio外，利用RNA integrity number (RIN)值來判斷RNA片段的完整性是另一個評定RNA品質較為重要的指標。但RNA相對來講較不穩定，也容易受到很多因素的影響而發生降解。
因此，獲得高品質的RNA樣品變成是許多研究者努力的目標。在人體眾多的組織中，胰臟組織又因為富含RNase、DNase跟protease的關係而更加難以取得高RIN值的RNA樣品，因此在2018年所發表的文章中，作者利用胰臟組織，針對從採樣到萃取等五個不同的條件來加以探討影響RNA品質的因素：
1. 研磨組織的方法：此篇文章中，作者分別利用了人工的方式或是自動研磨機來進行胰臟組織的研磨，進而比較不同方式間所萃取出的RNA總量以及RNA的品質(RIN值的高低)。結果顯示不同的研磨方法除了會影響獲得的RNA總量外，在RNA品質(RIN值)上並沒有明顯的影響。
- 註1：所有的研磨步驟都在10分鐘內完成。
- 註2：所有的樣品都是利用Qiagen RNeasy mini kit來進行RNA的萃取。
3. 組織的大小：文章中，作者也分別將樣品組織分成 <100mg與 >100mg 兩種不同的大小來置於RNAlater中保存，來探討取樣組織的大小是否會影響到RNA萃取的品質。結果顯示在 >100mg的實驗組中，RNA品質明顯的偏低，由此推測當取樣組織太大時，會影響RNAlater進入到組織內的效率進而降低RNAlater抑制RNase的功效。
4. 樣品從採樣後到存放進RNAlater的時間：文章中，分別將樣品在取樣後於10分鐘內將樣品至於RNAlater中或是在採樣30分鐘後才將樣品置於RNAlater中等兩種不同的情況來進行探討。結果也顯示，從組織採樣後，於10分鐘內就將樣品保存於RNAlater中，所獲得的RNA品質明顯優於30分鐘後才將樣品放入RNAlater中保存的樣品品質。而且如果同時考慮組織大小的因素後也發現，當組織不大於100mg且快速的放到RNAlater中保存最能保證RNA的穩定度。
結論
參考文獻
