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俗話說：“物以類聚，人以群分”。 人類在群居社會中，往往有抱團取暖的現象，而出乎我們意料的是，寄居在我們體內的病毒、細菌、寄生蟲等微生物竟然也有這種趨勢！！他們不僅會選著一個合適的地方定居下來，形成一個個“村落”，而且彼此之間還互有通訊，共同經營著他們賴以生存的...
原創文章 引用請註明出處 小小微生物，影響廣又深 - 美國微生物組研究計畫 過去，微生物曾經被研究人員所忽視，但是微生物廣泛存在於人體、土壤、海洋、植物等地球上各種環境中，可說是無所不在，這些微生物群落也大大影響著人類健康、糧食生產甚至是氣候變化。也由於微生物組對於地球及動植物影響巨...
腸型分析（Enterotypes） 腸型的發現 2011年，在nature雜誌第一次提出腸型的概念，並將其定義為“聚集在高維空間裡的微生物體特徵，是有限的宿主-微生物共生穩態時的微生物群落結構”；最早提出有3種腸型，分別以富集擬桿菌Bacteroides、普氏菌Prevotella和瘤胃球菌Ruminococcus（species group）為...
原創文章 引用請註明出處 過去十幾年做基因表現與調控網路的專家們都使用過微陣列 (Microarray) 平台作為研究工具，而在次世代定序技術出現後，想必一定常聽到要做基因表現分析應該要用RNA-seq來進行會比較好 ，那你一定會問小編，究竟哪裡好？總得給我個交待、給我個滿意的理由吧！！ 那小編就來為大家比較...
各位在NGS-轉錄組研究沙場上拼鬥時，是否曾糾結過定序策略的選擇問題？ 糾結1. 要進行雙端 (Paired End) 定序，還是單端 (Single End) 已足夠？ 糾結2. 讀長 (read) 的選擇又會如何影響後期的差異基因篩選？ 糾結3. 定序讀長的選擇是否越長越好？ 這些糾結問題，我們就交由一篇發表於 Genome Biology 的文章來面對...
GO （gene ontology）資料庫，收集的是對各種物種基因功能進行限定和描述的標準詞彙（term），是國際標準化的基因功能描述分類系統。根據基因產物的相關生物學過程（ biological_process）、細胞組成 （cellular_component）以及分子功能（molecular_function）三個大類分別給予定義，而每一大類下又包含更多層級具體ter...
原創文章 引用請註明出處 台灣生技醫療新趨勢 禮拜天準副總統大仁哥出席台灣癌症聯合學術年會提出，台灣未來應倡議『P4醫學』以邁向精準醫療降低不必要的健保支出，提升癌症病人存活率。大仁哥提出的P4醫學係指 (1) 預防醫學 (2) 預測醫學 (3) 個人化醫學 (4) 參與醫學。未來希望能透過個人化基因資訊結合大數...
定序完成後，接下來就是換生物資訊分析接棒了～ 在RNA-seq 項目中，常見的結果圖片包括：火山圖、文氏圖、聚類熱圖、log2(ratios)折線圖、有向無環圖、散點圖、代謝通路圖、蛋白質交互作用圖等。但是，經由生資高手所產生的圖片，若第一次接觸想必會有種我看過你、但我不認識你OS產生吧！所以接下來就讓小編來解讀一下...
目前對於腫瘤的治療，常見的手段幾乎就是手術切除，配合放療、化療。但即便是在非常早期發現腫瘤，且未發現附近淋巴結轉移的情況下進行手術治療，甚至做了附近淋巴結清掃的情況下，依然有許多病人會出現復發或轉移的現象。有許多患者，甚至產生了這樣的懷疑： 手術的治療，或者放療與化療會更快的加速疾病的轉移...
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