蛋白質定量分析
我們使用 iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術。這種技術使用同位素“標籤”將來自不同樣本的蛋白質進行標記,使它們在二級質譜圖分析時具有不同的分子量。因此,我們能夠區分出來自不同樣本的蛋白質,實現對“多個樣本”進行大規模蛋白質定量。這項技術主要適用於高通量樣品之間的蛋白質表達差異篩選。它不僅縮短了尋找蛋白質標誌的時間,還可以節省研發經費。圖爾思技術服務中心提供全台灣獨一無二的 iTRAQ 技術服務,從樣品製備到質譜分析再到生物信息學分析,我們提供全方位的服務,讓您無需擔心任何環節的問題。在台灣,我們圖爾思專業的服務團隊值得您的信任。
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服務內容
經過酵素處理的樣本,在化學反應中將 iTRAQ 試劑的特異性反應基團(amine specific peptide reactive group)與胜肽段的氨基末端進行共價連接(如下圖)。
不同樣本的胜肽段分別被iTRAQ113-121 (以8個樣本為例) 的標籤標記。 將標記好的8組胜肽段混合後,進行LC-MS/MS分析。由於8組樣品中相同蛋白質的同一條胜肽段被8種iTRAQ試劑分別標記後,其質量(M)仍然是一樣的 (8種同位素標籤搭配不同平衡團後其總質量為相同) 。因此,在一級質譜(MS1)上,它們的質荷比(m/z,質量/電荷比)值相同。經過碎裂反應後產生的碎片離子(fragment ions),可透過資料庫的搜尋推斷出胜肽段所屬的蛋白質。而胜肽段上釋放出來的8個報告基團標籤—113、114、115、116、117、118、119、121的強度即代表了8組樣品同一胜肽段的豐度(abundance)。
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。