蛋白質定性分析
樣本中的蛋白經由酵素水解成小片段的胜肽段後,圖爾思使用高分辨率的LC - MS / MS儀器(Orbitrap Elite ETD),依胜肽特性進行初步分離後,再通過質譜儀第一段質量分析器分離不同質荷比之肽段。由第一段質量分析器選擇誘導碰撞解離的肽段將會被分離為y-或b-離子,而這些離子被第二段質量分析器分離,通過計算相鄰的y-或b-離子的質量差異,即可計算出該胜肽的序列。
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單一蛋白質-序列/分子量/純度/胜肽圖譜鑑定
定序的原理和蛋白質ID相同,利用蛋白酶將樣本中的蛋白水解成小片段的胜肽段後,通過質譜儀分析每一段胜肽,依據其電荷質量比的不同數值分析出一級質譜圖,再藉由分析二級質譜圖可以得到蛋白質的胺基酸組成,但有別於蛋白質ID,蛋白質序列鑑定的服務會先評估蛋白的序列選用除了Trypsin以外的各種蛋白酶將蛋白質水解,再進行後續的LC-MS/MS分析。
項目包含:
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
項目包含:
服務名稱 | 服務說明 |
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單一蛋白質-純度測定-UV (Purity-UV) | 以 UV 214/280 nm 吸光值測定純度。 |
單一蛋白質-分子量測定 (Protein M.W.) | 蛋白質純度需 >50% |
單一蛋白質-已知序列鑑定 (Sequence ID) | 將已知的單一蛋白質以不同酵素(2~3個酵素)進行序列分析,蛋白純度需>50% ,序列覆蓋率可達>95% |
單一蛋白質-未知序列定序 (De novo sequencing) | 將已知的單一蛋白質以不同酵素(2~3個酵素)進行序列分析,蛋白純度需>95% ,序列覆蓋率可達>95% |
單一蛋白質-N端定序 (N-terminal sequencing) | 蛋白質純度需 >95%,提供蛋白質N端序列解序 (7-20 胺基酸) |
單一蛋白質-胜肽圖譜分析 (Peptide mapping) | Refernce protein 及 Target protein Peptide Mapping 結果 |
混和物-分子量分佈分析 (Peptides M.W.) | 檢測樣品內分子的分子量分布(0.3-20 kDa),不提供鑑定結果 |
混和胜肽-未知序列定序 (Peptide sequencing) | 提供樣品內胜肽可能之胺基酸序列解序(無法區分Leu/Ile) |
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
蛋白質身份鑑定(Protein ID)
圖爾思提供的蛋白質身份鑑定(Protein ID)技術服務讓您用最快速最準確的方式偵測樣本中的蛋白質組成份,利用質譜大規模地鑑定出樣本的組成,比起利用抗體等間接鑑定的方法更可以避免受到抗體專一性的影響。
我們提供多種樣本類型的分析服務,包含細胞pellet、動植物組織、分泌囊泡、膠體、血清、血漿...等,從樣品製備、上機、到最終生物資訊分析,圖爾思提供一條龍的技術服務。
項目包含:
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
我們提供多種樣本類型的分析服務,包含細胞pellet、動植物組織、分泌囊泡、膠體、血清、血漿...等,從樣品製備、上機、到最終生物資訊分析,圖爾思提供一條龍的技術服務。
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服務名稱 | 服務說明 |
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蛋白質身分鑑定-基本分析 (ID Basic) | 1. 鑑定蛋白質數目: 100-1,000 (基本), 100-3,000 (標準) 2. 膠體以3x8x1.5mm 為單位體積,超過酌收樣本處理費 3. 膠體取樣以單一區域(band/spot)為主,額外取樣每區需增收費用 4. 請提供蛋白質萃取液配方,或 Kit 名稱 5. 若欲檢測目標蛋白,請在送件單上註明並提供該蛋白序列 6. 服務301b/302b,客戶未提供蛋白濃度時,需加做服物蛋白質溶液濃度測量 7. Biotin及 IP 產物 (beads) 請依 post-IP procedure 處理,並去除多餘之上清液 8. 提供一組 database 比對之結果 (Database: UniProt or NCBI Refseq or Customized database) 9. 標準分析前,提供SDS-PAGE 或蛋白身分鑑定QC 結果。 |
電泳膠體蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
蛋白液體蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
生物素純化蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
免疫沉澱蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
蛋白質身分鑑定-質譜標準分析 (ID Standard) | |
電泳膠體蛋白質身分鑑定 標準分析 | |
蛋白液體蛋白質身分鑑定 標準分析 | |
生物素純化蛋白質身分鑑定 標準分析 | |
免疫沉澱蛋白質身分鑑定 標準分析 | |
蛋白質身分鑑定-客製分析 (ID Customized) |
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。