動植物全基因體定序 Animal/Plant Genome Sequencing
結合PacBio三代定序平台高準確率以及長片段定序的讀長優勢,既能準確檢測SNP/indel,更能正確分析大規模的基因結構變異 (SV/CNV)及 Allele Phasing,為全基因體研究(WGS)領域帶來全新視野
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服務流程
項目週期:樣品通過檢測後,40 個工作天。
樣品需求
1. DNA總量:
1. PacBio平台定序:
High Molecular Weight Genomic DNA, HMW DNA ≧ 10 ug
2. DNA 濃度: ≧ 100 ng/ ul (Qubit®測定)
樣品體積: ≧ 50 ul
※濃度及體積為個別的建議最低要求,總量仍需達到 10 ug
※如有純化或片段篩選需求: 建議總量 ≧ 25 ug
2. 樣品純度及片段大小:
OD260/OD280 = 1.8-2.0
OD260/OD230 = 2.0-2.2
要求主要DNA片段 ≧ 20 kb,無降解且無汙染
建議主要DNA片段 ≧ 40 kb,以取得更佳的定序品質
建議先行以0.6%-0.8 % Agarose Gel 電泳膠圖確認片段大小及DNA完整度,並於送件時提供膠圖結果
若樣品純度或片段大小分佈不符合要求,片段純化需額外收費
1. PacBio平台定序:
High Molecular Weight Genomic DNA, HMW DNA ≧ 10 ug
2. DNA 濃度: ≧ 100 ng/ ul (Qubit®測定)
樣品體積: ≧ 50 ul
※濃度及體積為個別的建議最低要求,總量仍需達到 10 ug
※如有純化或片段篩選需求: 建議總量 ≧ 25 ug
2. 樣品純度及片段大小:
OD260/OD280 = 1.8-2.0
OD260/OD230 = 2.0-2.2
要求主要DNA片段 ≧ 20 kb,無降解且無汙染
建議主要DNA片段 ≧ 40 kb,以取得更佳的定序品質
建議先行以0.6%-0.8 % Agarose Gel 電泳膠圖確認片段大小及DNA完整度,並於送件時提供膠圖結果
若樣品純度或片段大小分佈不符合要求,片段純化需額外收費
定序規格
三代長片段定序:PacBio Sequel IIe