當預測模型遇見自動化:讓CRISPR編輯更有效!
插入/缺失 (indel) 並非都是隨機
技術上或人為的差異可能導致CRISPR-Cas9誘導的插入/缺失 (indel) 編輯具有不可預測性,這使得人們普遍認為indels是隨機的。然而,近年來越來越多的證據表明CRISPR-Cas9編輯生成的indel並非隨機的。科學家們分析了數百個CRISPR-Cas9編輯的indels,並觀察到標靶特定的位點總是產生特定的修復結果。分析Cas9誘導的DNA修復模式可以幫助預測修復結果。Synthego的科學家更分析了包含數千個目標基因及其相關編輯效率的大型數據集。基於此分析,他們發現特定的目標序列和相應的sgRNA可以產生一致的indel模式(見圖1)。