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【代謝體技術分享】多體學研究:個人化風險評估-冠狀動脈心血管疾病 近幾年來精準醫療(個人化醫療)已成為全球發展趨勢,影響疾病的發展不再只有單一因素,像是不同地理區域、不同飲食習慣、不同年紀等等。本篇於2022年發表於《Nature Medicine》,利用代謝體 (Metabolomic) 和總體基因體 (Metagenome)來揭示個人化風...
許多研究人員會想要知道自己的樣本與對照組之間,蛋白質差異有多少,利用質譜儀(Mass spectrometry, MS)進行觀測,並透過軟體分析可以獲得差異蛋白(Differential protein)的結果,但是要如何進行後續的數據分析呢?就讓兔編來告訴大家 ! 除了找出含量有差異的蛋白質以外,越來越多研究也會透過基因的資料(differentially ...
|| DEG差異基因分析 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 大眾 vs. 小眾 關鍵的步驟,需要眾多的支持 差異基因的統計方法這麼多種,這種方法好嗎? 有沒有更多差異結果的呈現方法呢? 不論是實驗設計,或是選擇分析方法前,總會查詢文獻,並選擇Citation次數...
原創文章 引用請註明出處 上一篇文章跟大家分享了三代定序龍頭 Oxford Nanopore Technology (ONT) 在 2021 年的 21 件重要小事,怎麼可以錯過同為三代定序的龍頭 Pacific Bioscience (PacBio) 在 2021 年的進展呢?咱們輸人不輸陣,趕緊來看看在過去一年中,PacBio 發生了哪些重要事情吧! 本文主要架構取材 Pac...
|| QC 和 Mapping 不能簡單 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 嚴謹 vs. 簡單 好的開始是成功的一半 有好的數據品質,才能有好的分析結果! 數據真的OK嗎? QC真的不嫌少! QC結果一堆數值好難懂 Mapping的方式有差嗎? 你對品質控管真的安...
|| 從"頭"開始的細心 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 有跡可循 vs.無跡可尋 // 拿到RNAseq分析結果,是否會遇到以下情況? // 打開資料夾,看不懂檔案名稱 找不到需要的檔案位置 看不懂圖片/分析內容 才剛開始要閱讀數據就卡關碰瓷?! 這家...
【單細胞定序 新知分享】DISCO- 整合型單細胞圖譜參考資料庫 DISCO (Deeply Integrated Single-Cell Omics data) 是甫於2022年初發表的單細胞數據資料庫,深度整合多個單細胞技術平台將近4593例樣品,累積超過一千八百萬顆細胞的研究數據,涵蓋將近107種的組織/細胞/類器官 (organoid),其中也包含相當多來自COVID-19相關...
原創文章 引用請註明出處 各位捧油~新年快樂!! 過完了一個農曆年讓人真正感覺 2021 年已經離我們遠去,祝福大家 2022 年都能邁向更好的自己(●’◡’●) 本篇譯自 Oxford Nanopore 官網 [1],統整了 2021 年 Nanopore 本身技術或其使用者取得的關鍵進展,相信有些進展會讓你感到激勵人心、有些進展會...
mRNA在新冠疫情中異軍突起,成為炙手可熱的治療開發方向,目前在臨床用途主要集中在傳染病的疫苗、取代蛋白質或DNA進行基因治療遺傳性疾病或癌症。然而開發mRNA作為一種治療手段也面臨著與任何藥物投遞相同的挑戰:穩定性與傳遞。 首先mRNA依然可能激發急性免疫反應,進而被清除,無法有效地發揮功能。雙鏈和單鏈RNA...
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