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原創文章 引用請註明出處 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 總部設立於英國，是一家提供奈米孔偵測電流變化的定序儀製造商，該技術節省了光學訊號偵測時間，提供了比NGS更快速的定序工具。 ONT於2014年所發表的第一台定序儀–MinION，是在人工合成的高電阻薄膜上鑲嵌數百個奈米孔，奈米孔結構類似生...
原創文章 引用請註明出處 Pacific Biosciences of California (PACB) 是一家成立於2004年的生物技術公司，總部位於美國加州門洛帕克(Menlo park)，主要進行基因定序儀器的開發和製造。該公司於2020年10月5日發表旗下最新一代的定序儀器–Sequel® IIe System，提高了儀器的運算效率和新增原機數據處理...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #標準化 #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹Read count 標準化方法 || 小編偷偷問一個問題喔~ 你知道圖爾思 RNAseq 報告有3種標準化的表格，分別是： FPKM、TPM、RLE/TMM 。 看到這，是不是被這群不知是誰的標準化方法搞混了呢？又為什麼RLE後面還有接一...
你知道在做石蠟切片時，要是遇到含鈣的檢體， 而脫鈣是不可忽略的步驟嗎?市面上就有許多種類的脫鈣液可以選擇，這些種類脫鈣液成了之後染色結果好壞至關重要的一環。 在病理實驗製作切片時，經常碰到一些含鈣組織，而鈣十分堅硬，由於組織中的鈣和石蠟之間的密度不同，含鈣的組織不能直接製作切片。一般骨組織含鈣量...
原創文章 引用請註明出處 『我不怕，就算殺了一個我，還有千千萬萬個我。』～出自「功夫」的…理髮師。 今天小編就從科學上來跟你說其實這句話一點也不誇飾，甚至還含蓄了些。 你。不只是你。 如果說人體就是一個宇宙的話，這個宇宙的成員是細胞和各種各樣的細菌，數量甚至遠遠大於銀河系的恆星。即使...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #WGCNA #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹WGCNA性狀關聯分析 || 上篇介紹了 WGCNA 的基本概念，你非常有興趣並興致勃勃的準備了15 個以上的樣品，卻發現報告中 WGCNA 分析的結果比別人還少，這是怎麼一回事？ 小編說，本篇介紹的 WGCNA 分析內容...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #WGCNA #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹WGCNA || 做完了 DEG 和 GSEA 等兩兩組別比較的分析，你是不是想說有沒有一個分析方法可以同時看你的所有處理組別 RNA 表現的差異？ 如果你有 15 個以上的樣品，那恭喜獲得 WGCNA 的分析囉~~ WGCNA 會把數萬...
原創文章 引用請註明出處 先前的文章中有跟大家介紹基因變異依照型態和鹼基對長度可分為多類，而三代定序在大於 50 個鹼基對的結構變異偵測上有顯著較好的結果，關於不同變異平台之間比較可參考這篇：基因變異那麼多，到底要用哪個平台定序？ 結構變異在臨床上佔有重要角色，影響範圍包含孟德爾遺傳疾病、神經...
【代謝體技術分享】多體學研究 母體除了提供胎兒所需的營養外，胎盤[1]、陰道[2]、母乳[3]內的微生物都影響著胎兒的成長與腸道菌群的組成。本次分享於2021年發表於《Nature Communication》，有關母體陰道菌與早產的文章[4]。 為什麼要關注陰道菌？ 健康的腸道，通常保有豐富的菌群組成。但你知道健康的陰道，需要...
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