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研究微生物多樣性時，常會使用一種稱為“進化分支圖”的方式來呈現，這是在16S研究中常見的分析表現形式。 LEfSe (Linear discriminant analysis (LDA) Effect Size) 是一種用於發現高維生物標記和篩選基因組特徵的分析演算法，能夠在組與組之間尋找統計上具顯著差異的生物標識（Biomarker），即組間在豐度...
原創文章 引用請註明出處 母乳-腸道微生物-新生兒免疫 現今世界各國大力提倡母乳餵養，大家皆認為母乳能提供給新生兒完整的養分與免疫力。近年來人類腸道菌群生態(gut microbiome)越來越受到研究上的關注，舉凡焦慮、憂鬱、自閉症、免疫、代謝、營養、肥胖症、糖尿病、帕金森氏症、阿茲海默症等多種疾病已被發...
原創文章 引用請註明出處 The DNA Journey 多年前小編就看到不少基因公司或機構投入於人類尋根與藥物疾病預測的工作，目的就是希望能藉由檢測技術讓每個人都能更了解自己、看到更多自己所未曾了解的過去。舉凡祖先起源、家庭繼承、疾病風險預測、藥物反應預測都是被含括在內的項目，檢測方式則以唾液...
“知己知彼方能百戰不殆”，癌症是世界性難題，NGS為科學家們提供一條能夠戰勝癌症的方向，利用NGS對癌組織細胞進行測序，幫助科學家從基因層面認識癌症、了解癌症，以期找到能夠徹底戰勝癌症的方法。 小編就藉由一篇發表在 JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY雜誌 (IF:18.428)的研究《Next-Generation Sequencing...
從小到大不管是學習中文還是英文，都需要先學會一些中文詞或英文單字，有了基本的認識才能更深入的去學習。在NGS領域也是一樣，當然要先對專有名詞有基本的認識了解，才能學習起來不會一知半解也能快速的進入狀況摟～～ 既然要講重定序常見專有名詞，那當然要先論一下什麼是重定序呢？ 全基因體重定序是對已知...
“You Gonna Eat That? Appetite and Energy Balance” 1. 禁食，給減肥一個“冠冕堂皇”的理由 部分的瑜伽練習者會採取禁食的方法來進行練習，配以合理運動和調理，以達到身心健康和愉悅的目的。很多宗教人士也會定時禁食，從而使得身心得到淨化。那麼，對於禁食這項行動，科學近期進行...
俗話說：“物以類聚，人以群分”。 人類在群居社會中，往往有抱團取暖的現象，而出乎我們意料的是，寄居在我們體內的病毒、細菌、寄生蟲等微生物竟然也有這種趨勢！！他們不僅會選著一個合適的地方定居下來，形成一個個“村落”，而且彼此之間還互有通訊，共同經營著他們賴以生存的...
原創文章 引用請註明出處 小小微生物，影響廣又深 - 美國微生物組研究計畫 過去，微生物曾經被研究人員所忽視，但是微生物廣泛存在於人體、土壤、海洋、植物等地球上各種環境中，可說是無所不在，這些微生物群落也大大影響著人類健康、糧食生產甚至是氣候變化。也由於微生物組對於地球及動植物影響巨...
腸型分析（Enterotypes） 腸型的發現 2011年，在nature雜誌第一次提出腸型的概念，並將其定義為“聚集在高維空間裡的微生物體特徵，是有限的宿主-微生物共生穩態時的微生物群落結構”；最早提出有3種腸型，分別以富集擬桿菌Bacteroides、普氏菌Prevotella和瘤胃球菌Ruminococcus（species group）為...
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