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原創文章 引用請註明出處 有一句話說：「老化從腸道開始」，點明了腸道對於健康生理機能的維持之重要性，今年四月發布在Nature的一則新聞中提到的一個有趣研究，則是從腸道菌的角度進一步佐證這個觀點。該項研究以鏘魚(killifish)做為模式動物，觀察牠們的腸道菌對個體老化的影響。結果相當地有趣：研究人員發...
原創文章 引用請註明出處 在介紹標題中提到的兩種概念類似的分析圖之前，小編先簡單介紹一種熱門的微生物體分析工具：PICRUSt。它的全名是”Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States”，中文的意思就是”隱性狀態重建群落進化分析”。更白話一...
原創文章 引用請註明出處 相關性分析（correlation analysis）是研究隨機變量相關性的一種統計方法，用於研究現象之間是否存在某種依存關係，並對具有依存關係的現象探討其相關方向以及相關程度。這次小編就來為大家詳細介紹論文中常見的『優勢物種相關係數分析』及『物種關聯網絡分析』～～ 優勢物種S...
原創文章 引用請註明出處 精準醫療是近年來最熱門的話題，醫學界與科學界無一不投注心力在個人化醫療上，而過去研究都將重點放在人類基因體個體化差異與藥物作用上，但已有越來越多的研究指出藥物作用不僅受到基因調控的影響，也會因體內微生物的結構而有所差異[1, 2]。先前小編報導過目前已知超過60個藥物效果...
什麼是代謝體學? 代謝體學 (Metabolomics) 是指在特定的時間點下，對生物體內 (細胞，組織，生物體液) 的小分子代謝物進行定性和定量[1]。而代謝物 (metabolic) 泛指分子量小於1500 M.W.的物質，例如: 葡萄糖，脂質，胺基酸...等。 代謝物為生物系統中的最終產物，相較於基因或蛋白，更能直接表現生物體在特定時間下的狀...
原創文章 引用請註明出處 隨著大眾對於腸道菌的認識日益漸增，不少研究學者以及專家提倡以改變腸道菌相來達到治療疾病或是調整體質的做法。俗話說得好：「民以食為天」，人類自古以來便十分重視「吃」這件事，不只要吃得飽，更要吃得好。呼應今天的主題，小編想從腸道菌的角度出發，跟大家談談如何吃得巧，養出和...
原創文章 引用請註明出處 微生物分析時對於物種分佈情況的檢視，通常都會根據物種注釋結果，選取每個樣品或分組在各階層（Phylum、Class、Order、family、Genus）中相對豐度排名前幾名的物種（例如Top 10），由這些各分組中平均相對較高豐度的物種繪製柱狀圖，以便直觀查看各樣品在不同分類階層中相對豐度較高的物...
原創文章 引用請註明出處 人類腸道菌中，比例最高的兩種菌門為厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)，兩者比例可達全體腸道菌80%以上。許多學者普遍認為厚壁菌門是一群善於消化並促進吸收脂肪的細菌，牠們的大量存在使得宿主容易肥胖。小編聽說過壓力大時BMI容易爆增的理論，這也是跟腸道菌有關係喔！當...
原創文章 引用請註明出處 在微生物分析中，如何以視覺化呈現注釋資訊是一個重要的工作。通常在獲得OTU表及物種注釋資訊後，便需要將表格化資訊藉由視覺處理以利科研人員閱讀。目前最常見的方式如採用『物種階層累積柱狀圖』、『互動式Krona展示』、『進化樹展示』等，今天小編就先從物種階層累積柱狀圖介紹起，...
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