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60歲以上族群，估計有1%的人罹患帕金森氏症（Parkinson’s Disease）。帕金森病患會出現運動功能障礙等臨床症狀：靜止性震顫、運動遲緩、僵硬和姿勢不穩。這些病癥源自於黑質（SNc）中多巴胺能（Dopaminergic）神經元的逐漸喪失，導致多巴胺神經遞質信號相對減少；此外，研究發現帕金森氏症患者的神經元中具有大量由...
原創文章 引用請註明出處 Nanopore DNA以及直接RNA定序於國際太空站運行，圖片來源: NASA’s Johnson Space Center。 Oxford Nanopore Technology (ONT) 的願景是實現 “任何人、任何地方對任何生物的分析”，而 ONT 的願景也於 2016 超狂的於國際太空站實現 [1]，成為第一個於外太空進行定序...
核酸檢測( PCR ) 是這一年來火紅的名詞，疫情催化下即使不是有醫學背景的民眾，也開始對感染檢測有概念，因應新冠肺炎 PCR 在臨床上運用廣泛且成功，但當醫師假設錯誤、或是一個全新病毒出現，未必能及時地找出病原體，仍有其侷限性。 隨著科技日新月異，越來越多專家投入分子診斷領域中，利用總基因體次世代定序（mNGS）...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #富集 #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹基因富集分析 || 具有研究熱忱又認真的你開始整理所有找到的差異基因註釋，看看這些基因都是跟那些功能相關以及可能參與生化途徑，終於完成了精美的統計表格，老闆微笑看著你說，改變看看DEG篩選門檻吧！或許可以...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #GSEA #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹GSEA分析 || 上篇提要，在利用DEG篩選出差異基因後，為了更了解這些基因與pathway和疾病間有哪些相關，因此進行"基因富集分析"，使用的資料庫為KEGG、DO、GO。 你充滿自信的走進老闆辦公室，在老闆面...
臺中榮民總醫院自1982年成立，歷經39年兢兢業業，2021年初，以心房顫動電燒手術聞名的陳適安教授接第10任院長，引領全院發展「尖端醫療、精準醫療、智慧醫療、再生醫療」，而今年五月時，台灣爆發新冠肺炎境內感染，中榮是全國首家承接衛福部「北病南送」醫院、治癒率高達100%，成果值得和國內外專家分享，因此在中榮院慶...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #KEGG #DO #GO #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹基因功能資料庫 || 在得到差異表現量基因和相關圖表(MA plot/ Heatmap)後，你能夠在DEG Result Table 點擊各基因Ensembel_ID的資訊，了解更多關於該基因轉錄、轉譯等資訊。 你滿心歡喜的把上述...
在新冠肺炎疫情肆虐下，「感染症」成了近年來關注的焦點，但除了 COVID-19 以外，臨床上還有許多感染疾病仍威脅著患者生命，受限於傳統檢測的侷限，包含腦炎、肺炎、敗血症過半是找不出致病原，隨著精準醫療的發展，總基因體次世代定序（mNGS）逐漸成為精準診斷疾病的重要工具。 在今年 9 月 18日台中榮民總醫院主辦，亞...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #差異基因 #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹超高自由度Heatmap || 觀察基因表現量差異除了上篇 提到的MA plot和Volcano plot之外，大家最熟知的另一個圖就是 #Heatmap ! Heatmap 可以更直觀的觀察基因表現差異，但當拿到分析圖時，總會想，如果我.....
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