【RNAseq分析對決 -- 有跡可循 vs. 無跡可尋】

|| 從"頭"開始的細心 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 有跡可循 vs.無跡可尋 // 拿到RNAseq分析結果，是否會遇到以下情況? // 打開資料夾，看不懂檔案名稱 找不到需要的檔案位置 看不懂圖片/分析內容 才剛開始要閱讀數據就卡關碰瓷？！ 這家...

細胞動滋動：淺談膠原蛋白 (Collagen)與細胞移動

細胞移動 (Cell migration)對生物體至關重要，此機制仰賴胞器和細胞骨架纖維之間的功能和協調；因此細胞移動反映了細胞的發展程度，如果沒有移動的能力，細胞就無法生長、分裂或擴展區域。從事癌症研究、傷口癒合或藥物發現的科學家們皆經常需要利用細胞移動性實驗探討可能影響細胞生理過程和功能的條件和物質，因此體外細...

【單細胞定序 新知分享】DISCO- 整合型單細胞圖譜參考資料庫

【單細胞定序 新知分享】DISCO- 整合型單細胞圖譜參考資料庫 DISCO (Deeply Integrated Single-Cell Omics data) 是甫於2022年初發表的單細胞數據資料庫，深度整合多個單細胞技術平台將近4593例樣品，累積超過一千八百萬顆細胞的研究數據，涵蓋將近107種的組織/細胞/類器官 (organoid)，其中也包含相當多來自COVID-19相關...

如何利用3D細胞培養來研究病毒

3D細胞培養與2D細胞培養的比較 2D細胞培養已經被廣泛用於研究細胞和疾病機制，然而研究指出與2D培養系統相比，3D培養細胞的方式能反映組織中的微環境狀態。因此透過3D培養的方式，細胞的狀態與反應情況更接近於活體內，因此能提供更多的生理資訊 [1]。 在過去的十年研究中，3D培養已被用作藥物篩選平台、腫瘤細胞生物學...

2021年 --- Nanopore 21件最重要的小事

原創文章 引用請註明出處 各位捧油~新年快樂!! 過完了一個農曆年讓人真正感覺 2021 年已經離我們遠去，祝福大家 2022 年都能邁向更好的自己(●’◡’●) 本篇譯自 Oxford Nanopore 官網 [1]，統整了 2021 年 Nanopore 本身技術或其使用者取得的關鍵進展，相信有些進展會讓你感到激勵人心、有些進展會...

Synthetic mRNA：金鑰傳遞者

mRNA在新冠疫情中異軍突起，成為炙手可熱的治療開發方向，目前在臨床用途主要集中在傳染病的疫苗、取代蛋白質或DNA進行基因治療遺傳性疾病或癌症。然而開發mRNA作為一種治療手段也面臨著與任何藥物投遞相同的挑戰：穩定性與傳遞。 首先mRNA依然可能激發急性免疫反應，進而被清除，無法有效地發揮功能。雙鏈和單鏈RNA...

【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (下)】

原創文章 引用請註明出處 在上個月的文章【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (上)】中，介紹不同平台之間定序人類基因體 RM8392 細胞株的結果，比較了數據品質、覆蓋率、錯誤配對率等指標性數值。在這篇文章中，將為大家介紹不同平台定序人類基因體後，分析單核苷酸變異、插入/缺失...

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