探索空間轉錄體世界：10x Genomics的Visium 與Visium HD究竟有何不同？

嘿！您準備好踏上一場奇妙的空間基因體之旅了嗎？您是否曾想過能夠在組織切片上深入了解基因表現的神奇世界呢?  10x Genomics 的 Visium Spatial Gene Expression (Visium) 是一種具有突破性的空間轉錄體學技術。它利用了空間定位，結合了 NGS 高通量定序，使研究者能夠在組織切片上捕捉到基因表現的豐富訊息。

Visium 的方法原理是將 FFPE 組織切片貼附在特殊的晶片上，晶片上的偵測區域存在數以千計的偵測位點，並且帶有獨特的序列可區分位置，組織切片提前與偵測基因表現的探針反應再與晶片貼附後，切片上的探針轉移黏合至 Visium 晶片上，接著序列轉錄及建庫、 NGS 定序、生物資訊分析，能夠保留組織的空間結構分佈，提供整合基因表現的空間轉錄體資訊，讓您能夠深入了解細胞的分佈和功能。

而 2024 年更高解析度的 Visium HD 產品也正式推出，帶來了更進一步探索的可能性。就讓我們一起來看看 Visium 和 Visium HD 產品之間的差異吧!


Visium vs. Visium HD 的不同之處
1. 空間解析度：
   Visium：想像一下，你正在用放大鏡觀察一幅畫，就像是 Visium Spatial 提供的空間解析度，讓你能夠深入研究組織微環境的每一吋空間。
   Visium HD：如果 Visium Spatial 是放大鏡，那麼 Visium HD 就是更高倍數的顯微鏡！提高解析度能夠在細胞層級上更為精細地結合基因表現資訊，就像是探索細胞的微觀宇宙一樣。

相同面積下，Visium HD 將晶片的捕獲位點密度增加，提升解析度
© 2024 10x Genomics, Inc.

2. 基因表現數據：
   Visium Spatial：想像一下，你正在觀看 360p 的 YouTube 影片，Visium Spatial 能讓你看出物體的大致輪廓，但是缺乏更細節的資訊。
   Visium HD：當你將影片畫質從 360p 調整到 4K 的解析度，除了物體大致輪廓之外，也能看清楚更為細緻的紋理變化，在空間轉錄體研究上這對於發現細胞間的微小差異至關重要。

© 2024 10x Genomics, Inc.

技術優勢與應用場景
1. Visium Spatial：
優勢：適用於對組織整體的基因表達進行研究，在較為宏觀的解析度層級，研究組織型態與基因表現的關聯。
應用場景：一般解析度的 Visium 適用於研究初期的探索，比對疾病/腫瘤組織與正常組織間，或是發育分化過程中，不同組織的基因表現差異，找出可能的生物標誌。
2. Visium HD：
優勢：在更高的解析度提供全面的基因表現數據，就像是給你一張更為詳細的地圖，讓你能夠深入了解細胞之間的微小差異。
應用場景：高解析度的 Visium 除了能夠應用在一般 Visium 所適用的任何研究之外，對於以往較不適用的組織類型，例如腎臟 (可完整覆蓋單一腎絲球)，解析度的提升能帶來更多應用的可能性。
 
無論是剛開始踏入空間轉錄體領域，或是需要更高解析度專注細胞間微小差異的研究者，10x Genomics 的 Visium Spatial 和 Visium HD 都將為你帶來前所未有的研究體驗。快來開始你的探索之旅吧！
 
參考文獻
1. 10x Genomics. "Visium Spatial Technology." https://www.10xgenomics.com/platforms/visium
2. 10x Genomics. "Visium HD Spatial Gene Expression." https://www.10xgenomics.com/products/visium-hd-spatial-gene-expression