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2016．05
大家都說 RNA-seq 好，究竟好在哪裡？？
原創文章 引用請註明出處
過去十幾年做基因表現與調控網路的專家們都使用過微陣列 (Microarray) 平台作為研究工具，而在次世代定序技術出現後，想必一定常聽到要做基因表現分析應該要用RNA-seq來進行會比較好
，那你一定會問小編，究竟哪裡好？總得給我個交待、給我個滿意的理由吧！！ 那小編就來為大家比較一下 RNA-seq 
Microarray 摟～～豎起耳朵 
要開始摟～ 
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過去十幾年做基因表現與調控網路的專家們都使用過微陣列 (Microarray) 平台作為研究工具，而在次世代定序技術出現後，想必一定常聽到要做基因表現分析應該要用RNA-seq來進行會比較好
，那你一定會問小編，究竟哪裡好？總得給我個交待、給我個滿意的理由吧！！ 那小編就來為大家比較一下 RNA-seq Microarray 摟～～豎起耳朵 要開始摟～ 
(A) RNA-seq 不需預先知道基因序列，但 microarray 需預先知道基因序列
(B) RNA-seq 能偵測到所有的表現基因，即具有發現新基因的能力 (novel gene) Microarray 受限於探針 (probe) 設計，因此不具發現新基因的能力
(C) RNA-seq 偵測基因表現 (gene expression) 的靈敏度與解析度較 microarray 高
(D) RNA-seq 可同時偵測 SNP、InDel、Alternative splicing form
(E) RNA-seq 能偵測到『整個基因』的表現狀況，microarray 僅能就RNA與探針雜交之序列進行偵測
(F) 若RNA受到 miRNA 或其他後轉錄調控機制影響，RNA-seq 均能忠實反應
(G) 若基因在與探針配對處的序列發生變異，即便基因有表現，也會因序列沒法雜交 (hybridize) 而無法偵測到基因表現，但 RNA-seq 不受此變異影響，仍可正確偵測基因表現。
小編這樣的解釋，不知道大家滿意嗎？ 不過研究就像科技一樣，想發高點數論文就要用最夯的技術。每次推出最新款的手機大家都會搶購嘗鮮，那進行研究當然要來一下NGS摟～您說是不是呢！！
(B) RNA-seq 能偵測到所有的表現基因，即具有發現新基因的能力 (novel gene) Microarray 受限於探針 (probe) 設計，因此不具發現新基因的能力
(C) RNA-seq 偵測基因表現 (gene expression) 的靈敏度與解析度較 microarray 高
(D) RNA-seq 可同時偵測 SNP、InDel、Alternative splicing form
(E) RNA-seq 能偵測到『整個基因』的表現狀況，microarray 僅能就RNA與探針雜交之序列進行偵測
(F) 若RNA受到 miRNA 或其他後轉錄調控機制影響，RNA-seq 均能忠實反應
(G) 若基因在與探針配對處的序列發生變異，即便基因有表現，也會因序列沒法雜交 (hybridize) 而無法偵測到基因表現，但 RNA-seq 不受此變異影響，仍可正確偵測基因表現。
小編這樣的解釋，不知道大家滿意嗎？ 不過研究就像科技一樣，想發高點數論文就要用最夯的技術。每次推出最新款的手機大家都會搶購嘗鮮，那進行研究當然要來一下NGS摟～您說是不是呢！！
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