圖爾思十周年 特別人物專訪 - 賴信志主任

賴信志 主任

長庚大學 微生物相研究中心主任

長庚大學 特聘教授

台灣微生物學會常務理事
台灣微菌聯盟理事

▍為解決抗發炎藥物長期副作用問題 發現中草藥多醣結構與細胞作用的重要性

十幾年前發炎體(​inflammasome​)是非常熱門的，我從純細菌研究，後來做動物跟免疫、病理到臨床，發覺到發炎體很有趣，發炎體是人體發炎的重要原因，實驗團隊開始有了調整發炎、調控發炎體的想法，嘗試使用靈芝、巴西蘑菇、牛樟芝等知名草藥，從它們的萃取物中做調控發炎體的研究。

在這段研究過程中已找到許多人體發炎細胞因子，但我不因此感到滿足，當時覺得只做抗發炎研究還不夠，剛好過程中也發現了另一個問題: 在這些三萜類的藥，若劑量高且長期服用很容易有藥物副作用，嚴重可能影響生殖或細胞凋亡。於是這段時間我同時做了關於多醣、抗發炎、減肥的研究，我是細菌學背景的人，起初不太相信中草藥，後來做老鼠實驗意外發現中草藥的多醣竟然還可以減肥，回憶這段實驗過程相當不容易，過程至少需要三個月的追蹤，加上前期適應階段與後續分析資料，整個實驗花了半年多，在實驗結果中發現無副作用產生，對於熱衷研究的我，也開始將實驗重心轉移到多醣這塊。

 

▍賴信志教授赴美參加Microbiota研討會 展現對研究的熱忱與實驗精神 

早期在中草藥研究中，菌較常被忽略，當時還沒有人發現原來中草藥多醣的複雜結構與細胞作用的重要性，以及多醣所扮演的角色和減肥的關係，這段時間我也積極參加美國microbiota一系列研究的研討會及演講，在這些microbiota的研究中，讓我和實驗團隊更清楚哪些菌株在腸道裡，進一步了解基因的功能，而減肥的動物實驗包含先讓動物適應環境以及後續的結果分析，所以研究過程中一有跡象就會開始進行下一階段的實驗，而在微生物相HMP的技術平台到後來NGS這方面，也開始有了與圖爾思合作，這過程中幫助我非常多。

 

當時實驗團隊從中草藥多醣了解到可能是中草藥養出了這些有用的菌群，而後我們與圖爾思合作NGS技術服務，並將這個結論定下來，在2015年在Nature Communication發表全球第一篇關於服用中草藥後養出的菌群，而此菌群在服用中草藥的情況下可幫助減肥的重要論文。
 

▍與圖爾思展開第一次合作的契機 後續結果令人滿意

第一次與圖爾思合作項目是16S菌種鑑定，而面對先前發表能減肥的菌群，它的組織結構多樣性實驗室都需要深入探究才能進行實驗，當時在台灣NGS也是剛起頭，圖爾思不是我第一個找的公司，我那時還不認識，圖爾思算是相對年輕的公司，而那時我非常想了解NGS技術，但其他公司後來給的結果跟我了解到的品質有嚴重的瑕疵，在互動的過程中有發現一些問題，譬如說，其中的一種，他可能很多連到species都沒有，這樣很難往下進行，可是在歐美國家的研討會中，他們已經開始有一些數據出現，如果我們要跟他們競爭，那不可能不解開這些菌群組成的謎。

 

而當時長庚有個產學生技學程和碩士學程，讓學生寒暑假會去校外實習，圖爾思是其中的一家，也就在這時開始接觸圖爾思公司，在一次兩次與我們討論關於研究主題能提供什麼工具與建議，到最後的結果也相當滿意。
 

▍與圖爾思共同發起臺灣腸道公民計畫 帶著信念造福人群

除了16S外，實驗室也有請圖爾思做代謝體服務，多次與圖爾思合作下來的感受都非常好，實質對我們的實驗幫助很大，基於對研究的熱忱以及希望造福人群的初衷，進而發揮科學家的影響力。

 

當西方科學家認為短碳鏈脂肪酸已經可以解釋多醣主要的機制，最近兩三年卻開始有一些質疑的聲音出現，也許有其他的代謝物尚未被發現。為了了解細菌最後在身體中分解出哪些有效分子，這幾年實驗室也請圖爾思分析許多不同的代謝體，從體外、老鼠到人類反覆進行實驗，目前我們的結果是認為有短碳鏈脂肪酸以外的其他代謝物也涉略其中。

 

許多代謝物和細菌都會因為現有資料庫限制下尚無法定義清楚，因此我和圖爾思在2017時共同發起「臺灣腸道公民科學計畫」，希望號召臺灣民眾了解自己的腸道菌，透過資料庫去定義所謂健康人的腸道菌相會是甚麼樣子? 若是不健康又應該補充什麼菌，或是吃什麼讓好菌定植下來。

 

▍軟硬實力兼具 完整設備與生資團隊精細呈現完美的成果

早期跟圖爾思合作16S NGS到現在，這些年來我覺得圖爾思的軟體跟品質和其它生技公司有很大的不同，圖爾思給的資料不是做出來丟給你就了事，他背後擁有強大實驗團隊與生資技術人員支持著，經過精細地分析後才提供你需要的成果，過程中也清楚讓我們了解整個來龍去脈。

 

有完善的資源和堅強的團隊，圖爾思讓我在合作和互動過程中，真實感受到有一群志同道合一起成長的夥伴們，讓我們在挑選菌及決定代謝物的時候能有好的方向，這方面的品質已經不輸美國及歐洲一流的生技團隊！團隊2022年發表於Gut的最新研究，圖爾思郭育倫博士亦為論文共同作者，協助完成生物資訊分析。

 

圖爾思彌補了臺灣生技環境的研究空缺，有許多研究是一般實驗室無法執行的，例如NGS需要機器、人員維護與分析人才，而圖爾思能解決這些問題，且提供令人滿意的服務品質，特別是我個人對於結果和品質相當要求，非常感謝圖爾思讓我能夠拿著值得信賴的data投稿與世界並肩競爭。

• 延伸閱讀: 圖爾思生資團隊協助賴信志教授發表最新微生物研究成果_Gut (IF: 23.059)