07 2022．04

【RNAseq分析對決 -- 近水救火 vs. 遠水救火】

|| 立即擁有GSEA、PPI、WGCNA ||

到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往?

本集對決內容 -- 近水救火 vs. 遠水救火

羅馬不是一天造成，一張或一份精美的分析結果也不是彈指間就能完成。每張分析圖表、每種分析結果都是經過生資人員 用心研究、精心雕琢 而得。

一次就選對，為你保留人力、時間與金錢！

這家的近水救火和那家的遠水救火，對決結果會是如何？？

▍ 近水救火：即時提供GSEA、PPI、WGCNA

你急需用水，近處已有挖掘好的豐沛水源，便利又快速。

GSEA、PPI、WGCNA為圖爾思常規RNAseq分析內容

你需要的時候，數據隨手可得
你寶貴的時間，已節省4週以上
你重要的經費，為你安心守護

隨時STAND BY，不需等待！

▍遠水救火

你急需用水，但遠方的救火處才正要開挖水源，耗時又耗財。

想要開發新的數據分析，還需經過生資人員的文獻評估、開發、測試、修正、測試、修正，最後正式上線也經過了4週以上的時間。畢業的時間寶貴、研究的經費有限，耗時溝通、等待又花錢。

▍ 圖爾思GSEA分析

GSEA提供你另一種基因富集計算的選擇，不再局限於門檻值框架。

每個分析都有優缺點，DEG系列的分析結果是基於"特定篩選門檻，選出差異基因"，可能會因此忽略掉未達篩選門檻、但對pathway有重要貢獻的基因。

GSEA分析就是為了解決上述的問題而誕生!

有些人可能會使用Broad Institute GSEA 軟體來做GSEA，但相關操作不僅繁複，且僅能得到GSEA plot和簡單版heatmap。

圖爾思GSEA分析提供：GSEA plot、富集點圖、網絡圖、基因表現量熱圖...等。

> 了解更多GSEA原理

▍圖爾思PPI分析

了解蛋白質間交互作用，有助於對基因表現差異或疾病的了解。

藉由對應 STRINGdb 資料庫，整合 protein-protein Interaction 資訊將基因的研究提升到類似功能、同源提升交互作用的基因群探討，並整合分析官網相關 Protein 的共通資料庫（PFAM、InterPro等）註釋結果。

圖爾思提供Top 50 degree結果以及Top 50 最顯著差異的網路圖結果。

> 了解更多PPI分析

▍圖爾思WGCNA分析

藉由整體基因表現趨勢，不先預設分組與比較等資訊，從基因表現的加權相關性，獲得不同趨勢模塊，再從基因表現模塊篩選基因。

通常可配合感興趣的性狀資料與模塊進行相關性分析達到關鍵基因找尋的目的。

>了解更多WGCNA

近水救火與遠水救火，誰武力High?

下集 能動能靜 vs. 安安靜靜 ，RNAseq分析對決，下次見!

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2022．04．07