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2016．05
體內微生物會影響你我的健康嗎？
微生物無處不在，無所不為。人體微生物組被稱為“人類第二基因組”，人類腸道內就有多達1000種的共生微生物。千萬不要小看微生物，我們須和它們和諧相處才能保證身體的健康。近年來研究者們還發現許多疾病都和微生物密切相關，下面說說幾項重要的研究成果吧。
肥胖關微生物甚麼事兒？
文章題目：Richness of human gutmicrobiome correlates with metabolic markers
發表期刊：Nature，2013
影響因子：42.351
材料選取：123位非肥胖和169位肥胖的丹麥人糞便樣本
測序策略：illumina測序平台，宏基因組測序，平均每個樣本68.2 million high-quality reads
研究結果：
1）肥胖和非肥胖樣本中腸道微生物基因和物種豐富度上有明顯差異，且其中已研究明確和未明確的細菌都存在差別，而豐富程度低的人肥胖程度、血脂異常和胰島素抗性都有所提高。
2）僅對少數幾種細菌標記進行分析，就可以區分細菌豐富程度的高低。
2）僅對少數幾種細菌標記進行分析，就可以區分細菌豐富程度的高低。
圖1 豐富程度低（LGC）的人更容易肥胖
文章題目：Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome
發表期刊：Nature，2014
影響因子：42.351
材料選取：15位健康人的各18處身體部位採樣
測序策略：illumina HiSeq測序平台，宏基因組測序，總共得到289G數據
圖2 皮膚中細菌、真菌和病毒的物種組成
文章題目：Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control
發表期刊：Nature，2013
影響因子：41.456
材料選取：血糖正常的、不正常的以及正在進行血糖控制的70歲歐洲婦女的糞便樣本，共145例
測序策略：illumina HiSeq 2000測序平台，宏基因組測序，每個樣本3.1Gb的數據量
圖3宏基因組簇數目和基因數目 (a)(b)MGCs中各分類水平所佔比例 (c) NGT and T2D人群中800個最大MGCs相對豐度
文章題目：Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence
發表期刊：Nature Communications，2015
影響因子：10.742
材料選取：57例健康人、44例腺瘤病人和46例結直腸癌病人
測序策略：illumina HiSeq PE100測序平台，宏基因組測序，平均每個樣本5G的數據量
圖4 腺瘤病和結直腸癌樣本間的基因標記
[1] Le Chatelier E, Nielsen T, Qin J, et al . Richness of human gutmicrobiome correlates with metabolic markers. Nature. 2013, 500(7464), 541-546.
[2] Oh J, Byrd AL, Deming C, et al . Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome. Nature. 2014, 514(7520), 59-64.
[3] Karlsson FH, Tremaroli V, Nookaew I, et al . Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control. Nature. 2013, 498(7452), 99-103.
[4] Feng Q, Liang SS, Jia HJ, et al . Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence. Nat Commun. 2015, 6,1-13.
