05/12
2023
05/12
2023
穿越時間與空間的連結 - 單細胞與空間轉錄體技術分享會
2023.5.12 (六) 南港六福萬怡酒店
共70位專家學者齊聚，共同交流單細胞實驗與分析的經驗！
邀請4位單細胞技術專家上台分享其中的血與淚
▎高雄醫學大學 許雅玲 副院長
一個細胞的密碼-單細胞定序經驗分享
交流會的第一位講者是來自高雄醫學大學的許雅玲副院長，許教授重視細胞異質性的研究價值，從2019年就開始應用單細胞RNA定序技術，研究團隊已經處理過相當多的組織類型的單細胞樣品製備，會議中許教授從自身的經驗出發，提醒研究者開始應用單細胞RNA定序技術時，在實驗方面，即使是使用市售組織解離的解決方案，單細胞樣品製備仍然需要因應不同的器官，反覆測試並微調組織解離的實驗條件，在確保分離效果及盡可能保留脆弱細胞類型之間取得一個平衡，新鮮樣品的收樣保存及後續處理更是分秒必爭，目的都是最終可以保留更多的高品質細胞來分析，真實反映樣品內的細胞組成。分享的最後，許教授提及無論是單細胞RNA定序技術或是解析空間轉錄體資訊Visium等應用，摸索先進技術的過程中，難免會有失敗或是結果不如預期的情況，因此研究者之間的經驗交流格外重要，方能讓技術應用快速擴展到更多的研究領域。
▎臺北醫學大學 莊健盈 副院長
Integrating single cell multi-omics data for brain disorder research
莊健盈副院長分享自身於膠質母細胞瘤(glioblastoma)的研究結果，說明在異質性高的腫瘤微環境中，以單細胞定序技術成功尋找出高表達DNA 修復相關基因的細胞叢，並成功篩選出改變腫瘤微環境之有效藥物，進而抑制腫瘤形成。另外，將空間轉錄組(Visium Spatial Transcriptomics)應用於腦創傷研究，成功解決腦神經細胞於傳統單細胞定序上因細胞型態而產生的限制。經由空間轉錄組結果搭配ScATAC-seq數據分析，因而了解神經保護相關基因Znf179於腦創傷中所扮演的角色。
▎圖爾思生技 莊景凱 博士
從2D到3D：單細胞與空間轉錄體的應用與挑戰
會中莊景凱博士藉由文獻分享凸顯出單細胞多體學為未來單細胞研究的趨勢，而單細胞定序與空間轉錄組(Visium Spatial Transcriptomics)的搭配可為腫瘤微環境研究提供細胞在空間基因表達上的資訊，進一步幫助探討更詳細且全面的研究問題。而近期推出的Visium CytAssist，可幫助減少空間轉錄組實驗進行時轉移貼片失敗的風險。另外，Single Cell Gene Expression Flex (Single Cell Fixed RNA Profiling Kit)技術可混合多批次樣品，進而增加檢體收樣時間上的彈性，也可提高脆弱細胞進行單細胞定序的可能性。
▎圖爾思生技 謝馥媺 單細胞分析專家
探索單細胞多體學：分析方法與挑戰
馥媺在多圖爾思多年來專職分析單細胞數據，在這次會議中，綜觀單細胞定序的多體學面向，分享了結合第三方的軟體套件，能補足10x Genomics官方核心分析套件的不足，提供更為深入的延伸分析，包含多樣品的批次效應校正、細胞身份標記、細胞互動溝通網路等分析，再結合線上的雲端分析平台，讓客戶可以在簡單的滑鼠點選操作之下，自行調整分析的內容及篩選參數，也可以搭配Loupe Browser分析結果擴充應用，因應空間轉錄體Visium服務的推出，圖爾思在官方軟體提供的結果之外，能提供數項的延伸分析，例如 deconvolution 的分析策略能再將Visium數據的解析度進一步提升，也能協助客戶整合單細胞RNA定序數據分析，為客戶的數據創造更多價值，Make research happen!
回上一頁
共70位專家學者齊聚，共同交流單細胞實驗與分析的經驗！
邀請4位單細胞技術專家上台分享其中的血與淚
▎高雄醫學大學 許雅玲 副院長
一個細胞的密碼-單細胞定序經驗分享
交流會的第一位講者是來自高雄醫學大學的許雅玲副院長，許教授重視細胞異質性的研究價值，從2019年就開始應用單細胞RNA定序技術，研究團隊已經處理過相當多的組織類型的單細胞樣品製備，會議中許教授從自身的經驗出發，提醒研究者開始應用單細胞RNA定序技術時，在實驗方面，即使是使用市售組織解離的解決方案，單細胞樣品製備仍然需要因應不同的器官，反覆測試並微調組織解離的實驗條件，在確保分離效果及盡可能保留脆弱細胞類型之間取得一個平衡，新鮮樣品的收樣保存及後續處理更是分秒必爭，目的都是最終可以保留更多的高品質細胞來分析，真實反映樣品內的細胞組成。分享的最後，許教授提及無論是單細胞RNA定序技術或是解析空間轉錄體資訊Visium等應用，摸索先進技術的過程中，難免會有失敗或是結果不如預期的情況，因此研究者之間的經驗交流格外重要，方能讓技術應用快速擴展到更多的研究領域。
▎臺北醫學大學 莊健盈 副院長
Integrating single cell multi-omics data for brain disorder research
莊健盈副院長分享自身於膠質母細胞瘤(glioblastoma)的研究結果，說明在異質性高的腫瘤微環境中，以單細胞定序技術成功尋找出高表達DNA 修復相關基因的細胞叢，並成功篩選出改變腫瘤微環境之有效藥物，進而抑制腫瘤形成。另外，將空間轉錄組(Visium Spatial Transcriptomics)應用於腦創傷研究，成功解決腦神經細胞於傳統單細胞定序上因細胞型態而產生的限制。經由空間轉錄組結果搭配ScATAC-seq數據分析，因而了解神經保護相關基因Znf179於腦創傷中所扮演的角色。
▎圖爾思生技 莊景凱 博士
從2D到3D：單細胞與空間轉錄體的應用與挑戰
會中莊景凱博士藉由文獻分享凸顯出單細胞多體學為未來單細胞研究的趨勢，而單細胞定序與空間轉錄組(Visium Spatial Transcriptomics)的搭配可為腫瘤微環境研究提供細胞在空間基因表達上的資訊，進一步幫助探討更詳細且全面的研究問題。而近期推出的Visium CytAssist，可幫助減少空間轉錄組實驗進行時轉移貼片失敗的風險。另外，Single Cell Gene Expression Flex (Single Cell Fixed RNA Profiling Kit)技術可混合多批次樣品，進而增加檢體收樣時間上的彈性，也可提高脆弱細胞進行單細胞定序的可能性。
▎圖爾思生技 謝馥媺 單細胞分析專家
探索單細胞多體學：分析方法與挑戰
馥媺在多圖爾思多年來專職分析單細胞數據，在這次會議中，綜觀單細胞定序的多體學面向，分享了結合第三方的軟體套件，能補足10x Genomics官方核心分析套件的不足，提供更為深入的延伸分析，包含多樣品的批次效應校正、細胞身份標記、細胞互動溝通網路等分析，再結合線上的雲端分析平台，讓客戶可以在簡單的滑鼠點選操作之下，自行調整分析的內容及篩選參數，也可以搭配Loupe Browser分析結果擴充應用，因應空間轉錄體Visium服務的推出，圖爾思在官方軟體提供的結果之外，能提供數項的延伸分析，例如 deconvolution 的分析策略能再將Visium數據的解析度進一步提升，也能協助客戶整合單細胞RNA定序數據分析，為客戶的數據創造更多價值，Make research happen!
