06/13
2024
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2024圖爾思單細胞轉錄體工作坊 圓滿結訓
圖爾思微生物體研究中心
暨2022年生物資訊培訓班的滿滿好評，開放大家許願希望能在加開的課程內容，因此我們準備了近幾年來熱度不減的單細胞轉錄體作為這次的生物資訊工作坊內容!
2024.6.13 (四) 在南港老爺行旅，聚集40位認真上進的學員，經歷了3小時的精神時光屋，與兩位講師一同學習!
上半場課程內容主要介紹10x Genomics 官方軟體 Loupe Browser和Cell Ranger應用與實際操作。學員們親身操作Loupe Browser將t-SNE、UMAP、Feature Plot進行細胞圓點大小調整、按照基因表現重新分群等，其他功能還有：比對參考序列 reads (alignment)、feature-barcode 矩陣 (feature-barcode matrices)、聚類分析結果 (clustering analysis)、基因表現量分析 (gene expression analysis)，講師也分享了操作上大家常碰到的問題，更準備了操作範例供學員練習使用。
緊接著下半場著重在RStudio、Seurat和圖爾思雲平台。為了減輕大家下載多個軟體的困擾，圖爾思生資團隊限時將RStudio整合到雲平台內，讓大家方便操作。課堂上提供大家幾個關鍵的指令，接續利用Seurat的公開程式碼如，進行單細胞分析獲得數據。
但對於非資訊背景的人來說，短短幾小時內學會RStudio的指令確實有難度，近8成的學員覺得此次課程有困難度。
別擔心! 如果以上的課程內容無法快速吸收，圖爾思scRNA雲平台會是您的好幫手，因為不需要有程式語言的基礎，也不需要搞懂複雜的指令，載入rds.檔後一鍵即可完成各項分析內容，包括延續10x官方分析結果的DEG、GO、KEGG，以及擴充批次校正、細胞軌跡分析等內容。圖爾思雲平台有著互動式介面，可彈性調整相關參數，是科學家的分析好幫手!
感謝這次參與的所有學員，工作坊也順利結束，透過課後問卷調查，整體上學員都給予高滿意度的評價，8成左右的學員認為課程內容有助於往後的研究探索，9成以上願意再繼續參加培訓課程，希望大家都收穫滿滿，我們下次見!
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2024.6.13 (四) 在南港老爺行旅，聚集40位認真上進的學員，經歷了3小時的精神時光屋，與兩位講師一同學習!
上半場課程內容主要介紹10x Genomics 官方軟體 Loupe Browser和Cell Ranger應用與實際操作。學員們親身操作Loupe Browser將t-SNE、UMAP、Feature Plot進行細胞圓點大小調整、按照基因表現重新分群等，其他功能還有：比對參考序列 reads (alignment)、feature-barcode 矩陣 (feature-barcode matrices)、聚類分析結果 (clustering analysis)、基因表現量分析 (gene expression analysis)，講師也分享了操作上大家常碰到的問題，更準備了操作範例供學員練習使用。
緊接著下半場著重在RStudio、Seurat和圖爾思雲平台。為了減輕大家下載多個軟體的困擾，圖爾思生資團隊限時將RStudio整合到雲平台內，讓大家方便操作。課堂上提供大家幾個關鍵的指令，接續利用Seurat的公開程式碼如，進行單細胞分析獲得數據。
但對於非資訊背景的人來說，短短幾小時內學會RStudio的指令確實有難度，近8成的學員覺得此次課程有困難度。
別擔心! 如果以上的課程內容無法快速吸收，圖爾思scRNA雲平台會是您的好幫手，因為不需要有程式語言的基礎，也不需要搞懂複雜的指令，載入rds.檔後一鍵即可完成各項分析內容，包括延續10x官方分析結果的DEG、GO、KEGG，以及擴充批次校正、細胞軌跡分析等內容。圖爾思雲平台有著互動式介面，可彈性調整相關參數，是科學家的分析好幫手!
感謝這次參與的所有學員，工作坊也順利結束，透過課後問卷調查，整體上學員都給予高滿意度的評價，8成左右的學員認為課程內容有助於往後的研究探索，9成以上願意再繼續參加培訓課程，希望大家都收穫滿滿，我們下次見!
